Nature et environnement Milieux naturelsMalgré sa faible superficie, l'archipel comporte un grand nombre de milieux naturels intéressants, souvent influencés par l'océan : - des plages de sable, des dunes et des prairies côtières. L'isthme de Miquelon-Langlade renferme notamment, dans sa partie nord, la lagune du Grand Barachois et des marais avoisinants, composant un milieu salé - saumâtre original et exceptionnel ;
- des falaises abruptes favorables à la reproduction d'oiseaux marins ;
- des tourbières à sphaignes parsemées d'étangs et de marécages, sur plus de la moitié des îles, où prolifèrent mousses, lichens, sphaignes et orchidées ;
- des sommets dénudés, appelés localement "Mornes", accueillent des formations à Ericacées ; les espèces poussant sur leurs flancs exposés au vent sont souvent atteintes de nanisme ;
- des vallées de torrentss'écoulent vers la mer, généralement couvertes d'un boisement relictuel boréal, composé essentiellement de conifères (Sapin baumier, Epicéas blanc et noir, Mélèze laricin).
Flore et fauneLa flore est composée d'environ 600 espèces phanérogames (ou plantes à fleur ou cône) et 300 cryptogames (telles les mousses ou fougères). Une grande partie de cette flore est aquatique ou semi-aquatique. Les poissons d'eau douce ne sont représentés que par quelques espèces : omble de fontaine, éperlan et anguille. Il n'y a pas de reptiles dans l'archipel, et les amphibiens ne sont représentés que par la grenouille verte introduite. Les mammifères terrestres sont également peu nombreux. Les seules espèces indigènes sont le Campagnol des prés et le Renard roux. Trois espèces d'herbivores ont été introduites pour des raisons cynégétiques : le Lièvre variable en 1881, le Cerf de Virginie en 1953 et le Lièvre arctique en 1982. La souris domestique et le Rat surmulot ont suivi les migrations des hommes. Cependant, les eaux territoriales abritent quelques mammifères marins, parmi lesquels le Dauphin à flanc blanc, le petit Rorqual, le Rorqual commun, la Baleine à bosse. Il est également possible d'observer épisodiquement des Orques ou des Cachalots. Les bancs de sable du Grand Barachois servent de zones de repos aux colonies de phoques communs et de phoques gris.  La faune est essentiellement composée d'oiseaux migrateurs : près de 300 espèces ont été inventoriées (Rapaces, Limicoles, Anatidés, Laridés, Passereaux...). Certaines hivernent dans l'archipel, comme l'Eider à duvet, le Canard Arlequin ou le Harfang des Neiges, d'autres y nichent, comme la Bernache du Canada, le Pluvier Siffleur ou la Sterne Arctique.
Les espèces sédentaires se limitent au moineau domestique, à l'étourneau sansonnet, à quelques corvidés, aux mésanges et roitelets installés dans les bois. L'archipel comptait autrefois une espèce de "perdrix" indigène : le Lagopède des Saules, mais celui-ci a complètement disparu.
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